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Z-DNA

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Animierte Struktur der Z-DNA.
Animierte Struktur der Z-DNA.
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Seitliche Ansicht von A-, B-, und Z-DNA.

Z-DNA ist eine von verschiedenen möglichen Strukturformen der DNA. Es ist handelt sich dabei um eine linksgängige Doppelhelix (zu der in der Natur üblichen B-Form, welche eine rechtsgängige Helix bildet). Vermutlich ist die Z-DNA zusammen mit der A- und der B-DNA eine der drei biologisch aktiven DNA-Formen.

Inhaltsverzeichnis

Geschichte

Die Z-DNA wurde im Jahr 1979 als erste kristalline DNA-Struktur von Alexander Rich, Andrew Wang und Mitarbeitern am MIT entdeckt. [1] (siehe Röntgenbeugung). Jedoch wurde erst im Jahr 2005 über eine Kristallstruktur berichtet, welche Z-DNA direkt in einer Verbindung mit B-DNA zeigt und so aufgezeigt werden konnte, dass Z-DNA prinzipiell in vivo vorkommen kann. [2]

Struktur

Der Name Z-DNA leitet sich vom zickzackartigen Verlauf des Zucker-Phosphat-Rückgrates ab. Die Struktur ist aber im Vergleich zu der rechtsgängigen B-DNA sehr verschieden. Denn die Z-DNA ist linksgängig und hat eine Struktur, die sich alle zwei Basenpaare wiederholt (Dimere). Allerdings ist die Z-DNA eine metastabile Konformation der DNA und wird nur unter bestimmten Umständen eingenommen (wie z.B. alternierende Pyrimidine / Purine, hocher Salzkonzentration oder DNA supercoiling).

Funktion

Es wird vermutet, dass Z-DNA u.a. eine Rolle während der DNA Transkription spielt, wenn besonders viel supercoiled DNA vorliegt. [2] Ausserdem wurde beobachtet, dass das vermutliche Vorliegen von Z-DNA mit Transkritionsaktivität zusammenfällt und es wurde postuliert, dass Z-DNA bei der Regulation der Transkription eine Rolle spielt. [3]


Strukturinformationen der drei DNA-Formen, die biologisch relevant sein könnten
(B-DNA ist die in der belebten Natur häufigste Form)
Strukturmerkmal A-DNA B-DNA Z-DNA
helikaler Drehsinn rechts rechts links
Durchmesser ~26 Å ~20 Å ~18 Å
Basenpaare pro helikale Windung 11.6 10.0 12 (6 Dimere)
Helikale Windung je Basenpaar (twist) 31° 36° 60° (pro Dimer)
Ganghöhe (Anstig pro Windung) 34 Å 34 Å 44 Å
Anstieg pro Base 2.9 Å 3.4 Å 7.4 Å (pro Dimer)
Neigungswinkel der Basenpaare zur Achse 20°
Grosse Furche eng und tief breit und tief flach
Kleine Furche breit und flach eng und tief eng und tief
Zuckerkonformation C3'-endo C2'-endo Pyrimidine: C2'-endo
Purine: C3'-endo
Glykosidische Bindung anti anti Pyrimidine: anti
Purine: syn


Siehe auch

Quellen

  1. Wang AHJ, Quigley GJ, Kolpak FJ, Crawford JL, van Boom JH, Van der Marel G, Rich A: Molecular structure of a left-handed double helical DNA fragment at atomic resolution. In: Nature (London). 282, 1979
    Wikipedia
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    , S. 680-686
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    PMID 514347
  2. . a b Ha SC, Lowenhaupt K, Rich A, Kim YG, Kim KK: Crystal structure of a junction between B-DNA and Z-DNA reveals two extruded bases. In: Nature. 437, 2005
    Wikipedia
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    , S. 1183-1186
    Wikipedia
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    PMID 16237447
  3. Champ PC, Maurice S, Vargason JM, Camp T, Ho PS: Distributions of Z-DNA and nuclear factor I in human chromosome 22: a model for coupled transcriptional regulation. In: Nucleic Acids Research. 32, Nr. 22, 2004
    Wikipedia
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    , S. 6501-6510
    Wikipedia
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    PMID 15598822

Literatur

Voet et al, Biochemistry

Weblinks

Chemgapedia sehr schöne Bilder

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